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亚游游戏:方静平副教授

时间:2021-01-21浏览:3590

方静平


学位职称:博士,副教授,硕士生导师

E-mail:jinphia@fjnu.edu.cn

通讯地址:福建省福州市亚游游戏旗山校区理工楼13号楼 (350117)

硕士招生方向:生物化学与分子生物学、生态学、生物技术与工程专业。主要做植物基因组学和生物信息学方面的研究,特别欢迎计算机专业或者有一定计算机编程基础的学生跨专业报考。对linux系统、python语言、perl语言、R语言具有一定的基。ㄖ辽僬莆找幻疟喑逃镅裕,熟悉掌握awk/sed/grep命令。能够熟悉利用Photoshop、Ai绘图软件进行修图。

主要研究方向:

利用多组学技术阐释生物学机制辅助高优育种

植物物种比较基因组学与功能基因组学研究

功能性基因组结构变异鉴定

植物细胞器基因组水平基因转移和进化研究

开发分子遗传标记辅助经济作物育种

一、学习与工作经历:

2017.8至今    亚游游戏

2017.1-2017.6  福建农林大学基因组与生物技术研究中心 助理研究员

2013.7-2014.8  美国伊利诺伊大学香槟校区Ray Ming实验室 联合培养博士生

2010.9-2016.12 福建农林大学作物科学学院 农学博士(保研、硕博连读)导师:Ray Ming/陈如凯


二、主持或参与的主要科研课题

主持项目:

(1) 球等鞭金藻(Isochrysis galbana)岩藻黄素合成途径关键基因挖掘及其对光质的响应机制研究,41906096,国家自然科学基金青年基金,2020/01-2022/12,主持,在研;

(2) 甘蔗割手密(S. spontaneum)全基因组微卫星标记的开发和多态性鉴定,2019J05066,福建省自然科学基金项目,2019/04-2022/04,主持,已结题;

(3) 不同光质下球等鞭金藻(Isochrysis galbana)岩藻黄素生物合成的表达谱研究,JT180082,福建省教育厅项目(A),2018/10-2021/09,主持,已结题;

(4) 茉莉酸甲酯(MeJA)对茉莉花香气成分组成和含量的调控技术研究,福州市科技计划项目(星火计划),2021/06-2023/06,主持,在研;

(5) 甘蔗高贵种“中果”串联复制基因的基因组学特征研究,广西甘蔗生物学重点实验室开放课题,2020/07-2022/06,主持,在研;

(6) 2018-2019年福建省科技特派员工作经费,主持

(7) 2018-2021年福州市科技特派员工作经费,主持

(8) 2020-2021年福建市科技特派员“茉莉花种质资源创新和利用”团队,闽榕茶业有限公司,主持

(9) 亚游游戏人才引进科研启动项目,主持

(10) 亚游游戏2021年“溪源江学者”扶持计划项目(科研骨干扶持项目),2022/01-2023/01,主持,在研;

(11) 亚游游戏2018年“溪源江学者”扶持计划项目(科研骨干扶持项目),2018/11-2019/11,主持,已结题;


参与项目:

(12) 大肠杆菌持留菌耐药的遗传基础及杀灭新方法,2021J02029,福建省基金重点项目,2021/12-2024/12,排名第2,在研;

(13) 糖料副产物综合利用,部委其他项目,2021/06-2024/06,排名第2,在研;

(14) 蔗汁与糖蜜综合利用,部委其他项目,2017/01-2020/12,排名第2,已结题;

(15) 不规则互作图可靠性及其在蛋白质相互作用网络中的应用,61702100,国家自然科学基金,2018/01-2020/12,排名第2,已结题;

(16) 野生和栽培菠萝基因组结构变异的比较及其对重要农艺性状的影响,31701874,国家自然科学基金,25万元,2018/01-2020/12,排名第3,已结题;

(17) 番木瓜cpMYB24基因调控雄蕊发育的研究,2018J01601,福建省自然科学基金高校联合资助面上项目,10万元,2018/05-2021/04,排名第2,已结题;

(18) 文昌鱼性腺发育的分子机制,2019J01277,福建省自然科学基金高校联合资助面上项目,2019/04-2022/04,排名第4,已结题;

(19) 文昌鱼哈氏窝调控性腺周年变化的分子机制,JT180104,福建省教育厅项目,2018/10-2021/10,排名第4,已结题;

(20) 几种贝类开发保健食品原料和精深加工技术研究,企事业单位委托科技项目,2018/05-2021/04,排名第4,已结题;

(21) 虾蟹类加工副产物生产壳寡糖技术及产品开发,企事业单位委托科技项目,2018/04-2021/03,排名第5,已结题;


三、主要承担课程和参与的教改课题

承担本科生《科技写作与文献检索》、《生物化学实验》、《生物信息学》等课程;

细胞生物学,2020年福建省一流本科课程,参与;

细胞生物学,2019年五类“金课”建设项目,参与


四、发表期刊论文

已在《Nature Genetics》、《Plant Biotechnology Journal》、《Frontiers in Plant Science》、《BMC Genomics》、《Algal Research》等国际著名刊物以第一或通讯(含共一/共通)发表学术论文9篇,共参与发表中英文论文30余篇。

  1. Yue J#, VanBuren R#, Liu J#, Fang J#, Zhang X, Liao Z, Wai CM, Xu X, Chen S, Zhang S et al: SunUp and Sunset genomes revealed impact of particle bombardment mediated transformation and domestication history in papaya.Nature Genetics 2022, doi: 10.1038/s41588-022-01068-1.

  2. Wang P#, Fang J#, Lin H#, Yang W, Yu J, Hong Y, Jiang M, Gu M, Chen Q, Zheng Y et al: Genomes of single- and double-petal jasmines (Jasminum sambac) provide insights into their divergence time and structural variations. Plant Biotechnology Journal 2022, doi: 10.1111/pbi.13820.

  3. Chen Q, Zhang X, Fang Y, Wang B, Xu S, Zhao K, Zhang J, Fang J*: Genome-Wide Identification and Expression Analysis of the R2R3-MYB Transcription Factor Family Revealed Their Potential Roles in the Flowering Process in Longan (Dimocarpus longan).Frontiers in Plant Science 2022, 13: 820439.

  4. Lin E, Liao Z, Xu X, Zhang X, Fang J*: The complete chloroplast genome of the Chinese banyan tree Ficus macrocarpa. Mitochondrial DNA Part B 2022, 7(3): 423-425.

  5. Fang J, Wood AM, Chen Y, Yue J, Ming R*: Genomic variation between PRSV resistant transgenic SunUp and its progenitor cultivar Sunset. BMC Genomics 2020, 21: 398.

  6. Fang J*, Lin A, Yuan X, Chen Y, He W, Huang J, Zhang X, Lin G, Zhang J, Xue T: The complete chloroplast genome of Isochrysis galbana and comparison with related haptophyte species. Algal Research 2020, 50: 101989.

  7. Fang J, Wood A, Chen R, Ming R*: Molecular basis of off-type microsatellite markers in papaya. Euphytica 2016, 209(2): 323-339.

  8. Fang J, Miao C, Chen R, Ming R*: Genome-Wide Comparative Analysis of Microsatellites in Pineapple. Tropical Plant Biology 2016, 9(3): 117-135.

  9. Fang J, Lin A, Qiu W, Cai H, Umar M, Chen R, Ming R*: Transcriptome Profiling Revealed Stress-Induced and Disease Resistance Genes Up-Regulated in PRSV Resistant Transgenic Papaya. Frontiers in Plant Science 2016, 7: 855.

  10. 林恩文, 林榕榕, 陈钦常, 徐秀明,方静平*. 龙眼全基因组序列SSR位点的挖掘及特征分析[J]. 福建农林大学学报(自然科学版), 已接收.

  11. 方静平*, 陈钦常, 黄鹭强. 岩藻黄素生物合成途径及其对光照响应研究进展[J]. 亚游游戏学报(自然科学版), 2021, 37(5): 96-108.

  12. 林哲寅, 方静平*. ISO22000体系在大型活动餐饮服务食品安全保障中的应用[J]. 食品安全质量检测学报, 2021, 12(15): 6240-6248.

  13. 方静平, 林艺华, 杨川毓等. 抗环斑病毒番木瓜的开发技术及转基因对基因组影响研究进展[J]. 福建农林大学学报(自然科学版), 2016, 45(2): 121-128.

  14. 方静平, 阙友雄, 陈如凯. 甘蔗属起源及其与近缘属进化关系研究进展[J]. 热带作物学报, 2014, 35(4): 816-822.

  15. 方静平,苏亚春, 游倩等. 甘蔗β-1,3-葡聚糖酶基因的电子克隆与分析[J]. 生物信息学, 2012, 10(3): 199-207.

  16. Li Z, Xie D, Chi C, Zhou Y, Zheng M, Wang M, Fang J, He Y, Chen B: Efficient Strategy by a Newly Isolated Aspergillus oryzae to Harvest Chlorella vulgaris MBFJNU-1 from Original Swine Wastewater. ACS Sustainable Chemistry & Engineering 2022, 10: 5599-5610.

  17. Wang T, Fang J, Zhang J: Advances in Sugarcane Genomics and Genetics. Sugar Tech 2022, 24: 354-368.

  18. Zhao X, Song J, Zeng Q, Ma Y, Fang H, Yang L, Deng B, Liu J, Fang J, Zuo L et al: Auxin and cytokinin mediated regulation involved in vitro organogenesis of papaya. Journal of Plant Physiology 2021, 260: 153405.

  19. Wang B, Hu W, Fang Y, Feng X, Fang J, Zou T, Zheng S, Ming R, Zhang J: Comparative analysis of the MADS-box genes revealed their potential functions for flower and fruit development in longan (Dimocarpus longan). Frontiers in Plant Science 2021, 12: 813798.

  20. Chen D, Zhang Q, Tang W, Huang Z, Wang G, Wang Y, Shi J, Xu H, Lin L, Li Z et al: The evolutionary origin and domestication history of goldfish (Carassius auratus). Proc Natl Acad Sci USA 2020, 117(47): 29775-29785.

  21. Xue T, Sun M, Chen D, Yuan X, Liu K, Chen J, Ye H, Fang J, He W, Chen Y: Molecular Cloning and Overexpression of the Transglutaminase Gene from Streptomyces mobaraensis. Food Science and Technology Research 2019, 25(5): 687-694.

  22. Xue T, Chen D, Su Q, Yuan X, Liu K, Huang L, Fang J, Chen J, He W, Chen Y: Improved ethanol tolerance and production of Saccharomyces cerevisiae by global transcription machinery engineering via directed evolution of the SPT8 gene. Food Biotechnology 2019, 33(2): 155-173.

  23. Liu K, Yuan X, Liang L, Fang J, Chen Y, He W, Xue T: Using CRISPR/Cas9 for multiplex genome engineering to optimize the ethanol metabolic pathway in Saccharomyces cerevisiae. Biochemical Engineering Journal 2019, 145: 120-126.

  24. Zhang J, Zhang X, Tang H, Zhang Q, Hua X, Ma X, Zhu F, Jones T, Zhu X, Bowers J et al: Allele-defined genome of the autopolyploid sugarcane Saccharum spontaneum L.Nature Genetics 2018, 50(11): 1565-1573.

  25. Xue T, Liu K, Chen D, Yuan X, Fang J, Yan H, Huang L, Chen Y, He W: Improved bioethanol production using CRISPR/Cas9 to disrupt the ADH2 gene in Saccharomyces cerevisiae. World Journal of Microbiology and Biotechnology 2018, 34(10): 154.

  26. Miao C, Fang J, Li D, Liang P, Zhang X, Yang J, Schnable JC, Tang H: Genotype-Corrector: improved genotype calls for genetic mapping in F2 and RIL populations. Scientific Reports 2018, 8: 10088.

  27. Yang C, Powell CA, Duan Y, Shatters R, Fang J, Zhang M: Deciphering the Bacterial Microbiome in Huanglongbing-Affected Citrus Treated with Thermotherapy and Sulfonamide Antibiotics. PLoS One 2016, 11(5): e0155472.

  28. Ming R, VanBuren R, Wai CM, Tang H, Schatz MC, Bowers JE, Lyons E, Wang ML, Chen J, Biggers E et al: The pineapple genome and the evolution of CAM photosynthesis. Nature Genetics 2015, 47(12): 1435-1442.

  29. Guo J, Xu L, Fang J, Su Y, Fu H, Que Y, Xu J: A novel dirigent protein gene with highly stem-specific expression from sugarcane, response to drought, salt and oxidative stresses. Plant Cell Reports 2012, 31(10): 1801-1812.

  30. 陈兰平, 陈由强, 方静平, . 甘蔗SPS基因家族成员表达与糖分积累关系解析[J]. 热带作物学报, 2014, 35(7): 1354-1361.

  31. 张积森, 林清凡, 方静平, . 甘蔗SPSⅢ启动子区ATCT-motifCAT-box元件的酵母单杂交报告载体构建[J]. 亚游游戏学报, 2013, 29(1) : 86-89, 100.

  32. 张积森, 郑月霞, 方静平, . 甘蔗SPSⅢ基因启动子5’侧翼缺失的GUS表达载体构建[J]. 福建教育学院学报, 2012, (3): 118-121.

  33. 陈平华, 方静平, 许莉萍, . 球磨机高通量提取甘蔗叶片DNA研究[J]. 热带农业科学, 2010, 30(10): 8-12.


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